Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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