Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms