Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM28Q13263 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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