Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCP2Q13094 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms