Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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TRAF1Q13077 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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TRAF1Q13077 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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