Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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