Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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