Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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RASGEF1BQ0VAM2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RASGEF1BQ0VAM2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RASGEF1BQ0VAM2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RASGEF1BQ0VAM2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RASGEF1BQ0VAM2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RASGEF1BQ0VAM2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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RASGEF1BQ0VAM2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RASGEF1BQ0VAM2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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