Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LOXL1Q08397 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL1Q08397 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms