Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms