Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EGR3Q06889 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms