Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms