Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms