Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms