Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms