Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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