Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms