Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERFP50548 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERFP50548 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERFP50548 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERFP50548 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERFP50548 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERFP50548 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERFP50548 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERFP50548 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERFP50548 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERFP50548 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms