Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms