Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ME1P48163 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ME1P48163 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ME1P48163 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ME1P48163 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ME1P48163 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ME1P48163 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ME1P48163 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ME1P48163 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ME1P48163 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ME1P48163 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ME1P48163 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ME1P48163 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ME1P48163 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ME1P48163 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ME1P48163 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms