Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MTHFRP42898 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms