Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms