Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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CASQ1P31415 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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CASQ1P31415 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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CASQ1P31415 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASQ1P31415 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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