Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TSPOP30536 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TSPOP30536 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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