Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP1P29466 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP1P29466 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP1P29466 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms