Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PSMA3P25788 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMA3P25788 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms