Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5F1P24539 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms