Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPREP23469 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPREP23469 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPREP23469 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPREP23469 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPREP23469 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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