Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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