Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms