Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DEFA4P12838 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms