Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODC1P11926 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODC1P11926 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ODC1P11926 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODC1P11926 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODC1P11926 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODC1P11926 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ODC1P11926 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODC1P11926 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODC1P11926 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODC1P11926 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODC1P11926 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODC1P11926 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODC1P11926 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODC1P11926 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODC1P11926 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODC1P11926 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODC1P11926 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODC1P11926 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODC1P11926 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODC1P11926 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODC1P11926 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODC1P11926 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODC1P11926 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms