Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SFTPCP11686 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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