Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC192P0DO97 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms