Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMIGD3P0DMS9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms