Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB7P09629 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB7P09629 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms