Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POP4O95707 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POP4O95707 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POP4O95707 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POP4O95707 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POP4O95707 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POP4O95707 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POP4O95707 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POP4O95707 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POP4O95707 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POP4O95707 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POP4O95707 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POP4O95707 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POP4O95707 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POP4O95707 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POP4O95707 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POP4O95707 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POP4O95707 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
POP4O95707 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POP4O95707 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POP4O95707 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POP4O95707 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POP4O95707 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POP4O95707 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms