Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLOCKO15516 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.3 ms