Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DGG1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DGG1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DGG1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms