Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms