Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms