Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC26■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
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