Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PARP3Q9Y6F1 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
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