Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms