Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
YBX2Q9Y2T7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YBX2Q9Y2T7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
YBX2Q9Y2T7 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms