Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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