Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1BQ9UPS6 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms