Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VPS4AQ9UN37 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms