Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms