Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms